תלמידי התואר השני חייבים בעבודה מעשית מודרכת בהתאם לתחום המגמה שלהם. 

במגמות הקלינית והקלינית של הילד, עבודה זו צמודה לקורסים השונים ומתבצעת בבתי חולים,
במרפאות ובתחנות לבריאות הנפש. במגמות החברתית, הפסיכוביולוגית והקוגניטיבית יידרשו כל התלמידים
לבצע מחקר במסגרת אחד השיעורים שבהם הם משתתפים בשנה א'.
סיום חובות אלו בהצלחה הוא תנאי להמשך הלימודים.